Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BMP4P12644 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms