Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms