Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F6O75461 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F6O75461 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F6O75461 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F6O75461 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F6O75461 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F6O75461 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms