Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DENRO43583 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms