Protein–RNA interactions for Protein: O43281

EFS, Embryonal Fyn-associated substrate, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFSO43281 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFSO43281 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFSO43281 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFSO43281 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFSO43281 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFSO43281 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFSO43281 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFSO43281 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFSO43281 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFSO43281 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFSO43281 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFSO43281 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFSO43281 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms