Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms