Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCHNA4D1U4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms