Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9Y3F1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9Y3F1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9Y3F1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9Y3F1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9Y3F1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9Y3F1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9Y3F1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9Y3F1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9Y3F1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9Y3F1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9Y3F1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9Y3F1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9Y3F1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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