Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
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