Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms