Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms