Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms