Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms