Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
THUMPD3Q9BV44 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms