Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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