Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms