Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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SPOCK3Q9BQ16 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SPOCK3Q9BQ16 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SPOCK3Q9BQ16 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SPOCK3Q9BQ16 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SPOCK3Q9BQ16 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SPOCK3Q9BQ16 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SPOCK3Q9BQ16 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SPOCK3Q9BQ16 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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