Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms