Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A2Q96JW4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms