Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms