Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms