Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD2Q96C19 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms