Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms