Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms