Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms