Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms