Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
NUP35Q8NFH5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NUP35Q8NFH5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms