Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms