Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms