Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms