Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms