Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms