Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms