Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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