Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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