Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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