Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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C1orf61Q13536 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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