Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms