Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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