Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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