Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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