Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFEMP1Q12805 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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EFEMP1Q12805 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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