Protein–RNA interactions for Protein: Q01851

POU4F1, POU domain, class 4, transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU4F1Q01851 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POU4F1Q01851 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms