Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms