Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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