Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms