Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms