Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms