Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPAP53621 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COPAP53621 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COPAP53621 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COPAP53621 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPAP53621 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms