Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AMPHP49418 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPHP49418 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPHP49418 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPHP49418 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms